尹峰明确了将正式建立政府机构，在场的众人立刻明白了他的意思：这就是说，中华联合公司正式走出了建立一个国家的第一步。
曾棋站起来说道：“我们大家的目的是一致的，我们辛苦打下的江山，赚下的万贯家财，没理由拱手交给朝廷那帮子只会闹党争、贪污受贿、读死书的书呆子的。古人云蛇无头不行，无论是镇守府还是公司，我们都得有一个头领，我想这个头领只能是尹大东家，大家没有异议吧？”
大家伙都把头摇得象拨浪鼓，一致地说：“尹大东家就是我们的领头人……”
通过这一次会议，尹峰将公司对占领区地方行政管理部分的决定权基本上掌握在了自己一个人手中，不再需要走董事会的形式了。
同时，他还在德川家康身上赚了一大笔钱：德川家康终于在上一年年底开始了消灭丰臣氏的大阪之战。尹峰乘机提高价格，把卖给幕府的大炮提高了五倍价格。同时，他也偷偷地卖给丰臣家一些小型火炮和火绳枪，价格也是不菲。
尹峰在幕府和丰臣家两方总共赚了百万两白银，而且，这些钱是中华军出面赚下得，完全可以有尹峰一人来支配。
手头有了余钱，不需要公司董事会的同意，他立刻开始对中华联合公司进行机构大改组，将要成立台湾、吕宋两个镇守府，同时在吕宋下设五个县，台湾设立四个县（台北、台中、台南、台东），琉球和西婆罗洲各成立一个县，其余南洋殖民地依旧是由公司和中华军实行军事化管辖。
这样，大量的公司商务部、商情部、农垦部人员就得转为政府行政人员。由于尹峰规定行政管理人员必须在自己管辖区最起码连续待三年，这对那些在公司有大量股份、精于生意之道的伙计和职员非常不利，因此很多人选择继续待在公司内任职干活。
这样，在中华公司统治区，出现了地方行政官吏缺乏的现象。
万历四十三年五月，中华联合公司通过自己的商业网络和在商业政治上的人脉，向整个明朝统治区出了一个信息：台湾即将公开招考官吏了。
这简直就是公然造反之举，但是却真的有不少读书人去了台湾参加考试。
明朝科举考试使得所有读书人要想得到出路就只有做官这么唯一一条路。整个中国，似乎除了做官，就没有其他值得读书的目标了。因此，那些久考不中的童生、无法进学家境困顿的书生，那些手无缚鸡之力除了读书一无所长的书呆子们，真的从各地陆陆续续赶来了一百号人，他们都想着在台湾做个官也是好的：至少，这里名义上还是大明属地，而且听说在此地做官不用刮地皮也能拿到高薪。
尹峰把如何招考这些读书人、以及如何把他们培训成为中华公司体制下的行政干部等等麻烦事全交给了曾老爷子和曾山。他自己来到水军军港魍港，为出征广东的叶华送行。
福建沿海已经不存在任何海盗海匪了，几百处海湾已经成为了中华联合公司控制下的海港。而在浙江和广东沿海，还有一些不属于中华联合公司的海上武装存在。
浙江沿海的舟山群岛和台州外海的三蒜岛、温州外海的南麂列岛等地，明朝初年都有一些居民常住。洪武年间开始禁海，汤和巡海后将这些外海岛屿居民强行迁入内地，甚至只给一天限期，否则就充军流放，导致几万岛民抛家弃产、连船只都来不及准备，划着门板做的木筏渡海迁往内地，饿死淹死无数民众。这些岛屿因此就成了无人荒岛，后来就成了倭寇和海盗们的乐土。
眼下这些岛上还有一些小打小闹的海盗武装，靠走私一些货物给中华公司过活，或者就是打劫一下没有悬挂中华联合公司蓝底中字旗的商船。
对于这些小股海盗武装，尹峰只是派出了飞龙号主力舰带着十艘三桅炮舰，在浙江沿海巡游一番后，召集了那些小股武装势力的头目在三蒜岛上集会。
三蒜岛后世人称海盗岛，不知它究竟是因岛型似蒜而得名，还是旧时岛上长满胡蒜，渔家常取之为食而得名。这小岛地形险要，海岛周边暗礁丛生，岛中天然洞穴贯穿，向来是浙江沿海海盗聚会之处。这一次来到三蒜岛聚会的海盗帮派大约有十几股，基本上包括了浙江沿海的所有海盗帮派。嘉靖大倭寇时期，浙江沿海海盗势力遭受重大打击，再也出不了王直这样的枭雄人物了，从此一蹶不振。来到岛上的海盗团伙虽然有十几股，但是所代表的海盗总数不过2ooo。
飞龙号庞大的身躯在一群小帆船之中显得非常不协调。陈衷纪作为尹峰的全权代表，正在从飞龙号上攀着绳网下到海面上的摆渡小艇上去。三蒜岛海岸边地势陡峭，不用小艇根本无法靠岸，而这种小艇是当地海盗常用的摇橹木船，可以在礁石险滩间来回穿梭，躲避官兵水师的追捕，当地人叫“咕嘎船”。