非洲是个多民族、多部族的大洲，除了极个别例外，多数国家境内都有数十乃至上百个民族，同样，一些民族又被分隔在几个不同国家，这些有些是自然因素所致，更多则为殖民宗主国“分而治之”做法酿成的恶果。由于许多非洲国家独立迄今不过几十年，民族国家的认同感还较淡漠，许多国民认同自己是“某族人”的理念要远胜过认同自己是“某国人”，部族冲突、边界纠葛、宗教矛盾，导致了几十年来非洲连绵不绝的冲突和纠葛，即使在各国首脑高谈阔论“非洲合众国”的此次峰会上，他们同样在正式场合对诸如达尔富尔、肯尼亚和刚果（金）等地的民族冲突束手无策。即使一度被誉为“非洲民族国家典范”的肯尼亚，也终于未能避过部族冲突这一死结。老话说得好，修身、齐家、治国而后平天下，在相当多非洲、尤其黑非洲国家自身的统一和国家认同尚待完善前提下，“非洲合众国”又何以实现？
不仅如此，“非洲合众国”理念所憧憬的经济强大、货币统一、军事一体，其实现均有诸多难以克服的障碍。
非洲各国经济虽发展较快，但殖民时代遗留下来的单一经济模式并无显著改变，大多数GDP增长较快的国家，如苏丹、安哥拉、塞拉利昂，均得益于石油或其它矿产品资源的开发，和其在国际市场价格的一路狂飙，历史上70年代的扎伊尔、80年代的尼日利亚都曾受益于此，但一旦市场波动，这些经济结构单一的国家无一例外将会受到极大冲击，甚至就此一蹶不振。而且由于前宗主国将非洲殖民地当作自身经济的原料来源，致使大多数非洲国家的经济模式严重依附前宗主国经济，而彼此间却缺乏互补，在这种情形下一旦变成“合众国”，就会变成“德克萨斯”有很多、而“加利福尼亚”和“密歇根”、“纽约”一个也没有的畸形儿。
非洲各国金融管控能力薄弱，大多数国家货币币值不稳定，许多甚至不能自由兑换，尽管非洲法郎区拥有统一的、稳定的、某种程度上可兑换的非洲法郎，但这一货币的实现和保持，却建立在法国金融体系支持和担保基础上，而除此之外，即使南非、尼日利亚、加纳这样的非洲强国，其货币币值也非常不稳，而几内亚、津巴布韦等国就更不用说了。在这样的金融基础上，“统一货币”的构想不啻空中楼阁。
卡扎菲曾认为，非洲各国国贫兵寡，独木难支，但一旦成立“统一军”，则会一下拥有一支可以和任何大国媲美、总兵力超过200万的强大武装，既能保家卫国，又能履行国际义务，这样一来，就可以对任何无礼要求和非份企图说不。由于部族化、区域化的特点，非洲大多数国家规模不大的军队本身，或只听命于某个强势民族，或被若干势均力敌的民族分而制之，对于不少非洲国家而言，“本国统一军”尚如镜花水月，不知何日方能实现，非洲统一军的前景更无需多谈。且200万军队听上去很美，但统一指挥、统一编制、统一后勤的前提是强大、持久、稳定的军费支持，和统一、坚强、高效的指挥管理体系，而这两点是当前非洲任何国家和个人都无法做到的。
可见至少到目前为止，“非洲合众国”仅仅是一个“口惠而实不至”的梦想：美好，但难以实现。也许5年后、10年后，非洲各国领导人仍会兴致盎然地探讨这一理念，正如他们从1999年至今一直所作所为的一样。