嘉靖44年（公1565年）9月25日，俞大猷等人率领宗擎和普从，以及1万多人的水军，并驾驶300多艘战船到达了澳岛不远处的面上，接着他们和沈舟、傅应嘉率领的水军会合后，俞大猷命人号弹，岛上的戚继等人看到号弹后下令大家一起围攻吴平，然后俞大猷和沈舟命令所有水兵驾驶艘福船向停在岸边的所有倭船和岛上的吴平开炮。
这场战争一直续到10月5日的凌晨，吴平率领800人驾驶40艘战船逃离了澳岛，澳岛之战中明军一斩首倭寇的首级1500多颗，烧死和淹死倭寇5000人。
后来俞大猷命汤克宽率领水军去追击，嘉靖45年（公1566年）初，吴平率领残部逃到了天境内的万桥山澳上，最后吴平残部汤克宽率领的水军全歼，吴平跳自杀，自此从朝开始的倭寇之患终于基本解决。不久，宗擎和普从和俞大猷、戚继、月满等人告就到了嵩山少寺，到少寺后宗擎和普从把俞家棍法给其他的少武僧。
澳岛之战结束后戚继到了一条消息，曾经的上司胡宗宪已于11月25日在狱中饮刀自尽的消息。原来在嘉靖41年公1562年11月7日，胡宗宪遭到了京户给事中陆凤仪的弹劾后，12月27日胡宗宪押送到京关进了大牢，不久，嘉靖皇帝念他抗倭有功，对胡宗宪网开一面命人把他出了大牢，嘉靖42年（公1563年）春天，胡宗宪到了家乡直隶徽州府绩溪县（徽宣城市绩溪县）。嘉靖44年（公1565年）3月24日，严蕃和同党罗龙文一起斩首后直隶巡按御王汝正在奉命对罗龙文的家中进行抄家时发现了一封，是胡宗宪写给罗龙文的，这封是几年前写的，几年前胡宗宪就遭到过一次弹劾，于是胡宗宪写给罗龙文，让他在严蕃面前替自己言几句。王汝正就把这封呈给了嘉靖皇帝，嘉靖皇帝看见这封后大怒下旨命人去绩溪县把胡宗宪押到京。10月23日，胡宗宪一次押送到京，并关进了大牢后，11月25日，胡宗宪觉得自己的人生走到了尽头，于是就在狱中的墙上写下了“宝剑埋冤狱，忠魂绕白云”的诗句后饮刀自尽了，时年54岁，一代抗倭臣就这样结束了自己的一生。隆庆6年（公1572年），朝廷为胡宗宪平反昭雪。万历17年（公1589年），追谥为襄懋。
胡宗宪的一生都献给了抗倭大业，戚继为胡宗宪最后却落得这样的下场而到惋惜，戚继决定要继承胡宗宪的遗，成胡宗宪未尽的事业。这次到胡宗宪牵连的人有卢镗和徐渭等人，卢镗是押到京城关进大牢，后来又免罪遣家乡处州卫（浙江丽水市莲都区），万历5年（公1577年），卢镗在家中病逝，享年73岁。徐渭于嘉靖45年（公1566年）间押送到京城关进大牢，万历年（公1573年）间，徐渭出大牢，万历5年（公1577年）间，他经戚继推荐，辽东总兵李成梁聘请徐渭为宾师，并李成梁的长子李如松、次子李如柏还跟随徐渭学习兵法。
胡宗宪生前曾经请幕僚、著军事地理学家郑若曾等人编写中国第一部防图《筹图编》，嘉靖41年（公1562年），《筹图编》刊刻问，在众多的防地图中，《筹图编》是最为权威的，正是在这中钓鱼岛明标注在中国版图。