尽管已经实行了如此严厉的法律，还是有人不顾一切出门逃生。这些人基本上都是家里没有粮食没有水，无法待在家中继续活下去。唯有想办法逃出来寻找生路，或者想去投奔亲戚，或者企图逃上城楼跳入洪水离开这座可怕的城市。
但是大街小巷都布满了巡逻的兵士，这些人都没能够达到目的，都死在了兵士的刀箭之下。
而巡逻的兵士也并没有能够幸免于难，兵士中也在迅速传播着瘟疫。经常能看到的就是巡逻的兵士会突然有人掉队，并倒在街边，大口地吐着鲜血，很快死去。
刚开始这种场景使得巡逻的士兵们惊恐万状，很是害怕。可到了后面，他们也麻木了。对倒下的同伴甚至已经没有人上前去管，因为他们每个人都害怕会因此染上瘟疫。
官府衙门的广场上，焚烧尸体的烟雾几乎就没断过，白日黑夜的一直烧着。因为不断的有尸体被送来，那些焚烧尸体所用的木材，原本用的是衙门厨房积攒的木头。可这些木材很快就用光了，于是便拆掉了衙门的一些旧房子拿来烧。
到了后面，衙门已经没有可以拆的房子了。这时候，京城里已经有一些人家都死绝了，又是贫困人家，家里没什么钱财的，于是便将这些房子也拆了用来焚烧尸体。
焚烧尸体的开封府衙门大院距离皇宫还是有些远的，但是站在皇城之上是还是可以看见从开封府大院飘起的滚滚浓烟。便可知道那是在焚烧瘟疫病人的尸体，这种烟雾滞留在空中，久久没有散去。
宋神宗在他的宫殿遥望天空，也能看见空中飘散的黑烟。他当然知道是怎么回事，心情异常沉重。这些烟雾白天黑夜就没断过，说明因为瘟疫死亡的人就没有断过，而且还越来越多。因为天上的黑烟越来越浓，到后来，几乎遮挡住了半个天空。
宋神宗已经连续下了几道圣旨，责令太医院尽快研制出治疗这种可怕瘟疫的有效药方来。但是下圣旨容易，要找到这样的方剂却很难。
太医院王院判已经急得跟热锅上的蚂蚁似的了，皇帝天天逼他，甚至不时把他找去训斥。每天他都要在紧张不安和惶恐中度过，所以他转过来又向下面的太医施加压力。这些太医一个个愁眉苦脸，没日没夜的蹲在太医院的藏书阁中查阅经典古籍，寻找有效的治疗方案。而太医院的医馆就是他们验证药方的试验场，患了病的官员及家属都会被送到这来救治，而不会象普通百姓那样被直接射杀或者将尸体火化。
这样一方面体现了对官员的特殊照顾，同时也给太医院的太医们一个试验药方的机会。只可惜这些太医找了数百个方子，引经据典，但是都没有任何作用。
就在这时，司马光上了一道奏折，保荐杨仙茅为太医院的御医。
宋神宗也听过杨仙茅的名号，知道杨仙茅是吴王的女婿，这在政治上是绝对可靠的。在医术上，他听说杨仙茅在治疗前一阶段瘟疫的成功率相当高，远远高于其他医馆的郎中。虽然对后面的这种新的瘟疫他也没有拿出好的方案来，但是如果把他招入太医院与其他太医共同商议，同时利用太医院丰富的皇家藏书，以他的聪明才智，或许就能最终找到治疗这种可怕瘟疫的药方来。
按理说要成为一个太医，那可不是掌握一两个偏方就能够当上的。必须有丰富博学的医学才能，并且在杏林界得到广泛认可，而且根正苗红知根知底的人才能进入太医院。
现在杨仙茅年纪太轻了，正常情况下，即便有司马光的保荐，宋神宗可能也会掂量一下，让他先到地方做几年医官，看看他的成就和表现。如果可以，再招他进太医院，又或者在太医院有疑难杂症时让他参与会诊，以便考验他的才学。
但是现在宋神宗没有选择，因为瘟疫已经使京城大量的民众死亡，甚至包括朝廷的官员和家属。虽然皇城采取了严密的控制手段，至今还没有出现瘟疫，但并不表示永远不会。一旦瘟疫在皇城中扩散开来，宋神宗不敢想象由此带来的后果会怎样。
所以他愁得寝食难安，像掉进洪水中的将死之人，但凡抓到什么东西，即便是一根稻草，也会当做救命的依托，更何况还是他最为欣赏的忠臣司马光的保荐。他相信司马光的眼光，于是几乎没有犹豫便下了旨，招杨仙茅入太医院为太医，并参与研制治疗瘟疫的药方的工作。
这道圣旨被送到杨仙茅医馆的时候，杨仙茅正在跟妻子白芷郡主商议，这种情况下要如何继续与药香郡主联络，以便继续生米煮成熟饭的计划。
现在看来这个计划实施难度很大，因为润王夫妻和药香郡主都在皇城里面。而皇城是严格控制着不让与外界连通的，这也是是皇城成为这一次瘟疫中的没有染病的孤岛的原因。