虽然曼施泰因的装甲部队找到了及其惨重的损失。但作为先头攻击部队的第19装甲师依然在配属的“虎”支持下突破了红军的防线。红军第81近卫步兵师只能将训练营拉过来阻止德军。第19装甲师在战斗中损失也相当严重，受创坦克约100辆，包括第503营配属的7辆“虎式”，兵员损失据称达到1000人。
在第19装甲师右侧，德第7装甲师进攻苏第78近卫步兵师的防线。第78近卫步兵师依托稠密的树林建立了坚固的防线，并在树林一侧的高地上布置了师属炮兵。德国人在红军炮击下伤亡严重，只得用第3连的“虎”式坦克吸引住苏军的反坦克火力，然后以中型坦克绕过防线，冲入苏联高射炮阵地，从侧后瓦解了红军防线。
第7装甲师继续前进，逼近了红军第二防御地带。在此据守的是苏第73近卫步兵师和第167、262坦克团。第7装甲师发动了连续攻击，但未能奏效。
当天下午，肯普夫将第6装甲师投入到了第19和第7装甲师之间，以求扩大战果。为此还给第6装甲师配置了第503营主力。但红军先后得到了第111、270步兵师，第15、94近卫师（后者来自方面军预备队）的支援，逐渐顶住了德军的攻势。
经过6月6日的战斗，肯普夫的3个装甲师和第106步兵师都已渡过北顿涅茨河，并向苏军防线推进了10-12公里。德军装甲先锋还沿3公里正面迫近了红军第二防御地带。肯普夫为此付出的代价依然很惨重，全天损失达2367人，再度超过了克莱斯特。连续两天下来，肯普夫的总损失超过5800人，相当于一个完整步兵师的“战斗力量”。
6月6日库尔斯克南部地空中战斗也很激烈。苏联第2、17空军集团军出动了1632个架次。和德国第8航空军的1686个架次大致相当。德国空军在第一天曾拥有的制空权受到了严重挑战。后来成为著名苏联空军王牌的阔日度布当天击落了1架ju87，开创了他地第一个记录。
经过6月6日的战斗，曼施坦因在苏军防线内的推进深度达到10-18公里。其整体态势是：党卫第2装甲军向东北突出了一块，在雅科夫列沃和卢奇基两个地段冲入苏军第二防御地带；但其两侧。无论是左侧第48装甲军，还是右侧“肯普夫”战役集群，都依然被阻止在第二防御地带前，进度落后于党卫第2装甲为了保证向奥博扬方向的推进，就必须让这些部队，尤其是第48装甲军能够跟上来。
尽管如此。德军高层依然对当天的战果表示满意。尤其是东线外军处。他们在当晚的报告中认为：苏军为了在离库尔斯克尽可能远地地方阻止德军，过早的投入了预备队，全部兵力都已经陷入战斗。这对德军下一步的进展无疑是有利的。
德国方面的判断并没有错。瓦图京确实已经投入了几乎全部坦克预备队。虽然因此缓解了德军对奥博扬的威胁，但攻势凌厉的党卫第2装甲军依然可能达成突破，并转而向东冲击普罗霍罗夫卡。瓦图京本人对此早有预计，此前在6月5日就命令第3近卫步兵军一个师开向普罗霍夫夫卡。而现在，瓦图京还需要一支坦克部队，以迎击德国最精锐的装甲军团。但他所拥有的坦克，相当一部分已经开进了战壕。根本无法用于机动。
为此，瓦图京在6月6日晚1时30分，通过大本营代表华西列夫斯基向斯大林请求更多地支援。他的要求得到了满足：草原军区第5近卫集团军第10坦克军（185辆坦克和自行火炮），西南方面军第2坦克军（168辆坦克和自行火炮），分别被调往普罗霍罗夫卡和南面的科罗恰。草原军区的第5近卫坦克集团军也开始向前移动。但在得到援兵的同时，瓦图京还接到了斯大林的电话，严令他不得让德军突破。瓦图京很清楚，决定库尔斯克和他本人命运的时刻来到了。
6月7日，库尔斯克南部战斗继续。早晨，德第4装甲集团军再度以第48和第2党卫装甲军。猛攻苏第6近卫集团军防守的阵地。