照此来说，萧瑀应当是李渊的铁杆。玄武门之变后，理应遭到打压才是。但是没有，李渊在位时的宰相，只有萧瑀一人保留了下来。原因是萧瑀是当时的几位重臣中，唯一一个提出立贤不立嫡的人。当时李世民与李建成争夺皇位进入了白热化，朝中重臣要么是支持李建成，要么不表态，唯有萧瑀一人明确支持李世民，还因此受到了李渊的训斥。
等到了李世民当了皇帝，自然要报答这份恩情，特进萧瑀为尚书左仆射。还作诗送给他，就是那首许多人不知名字，但是都听过的：“疾风知劲草，板荡识诚臣。勇夫安知义，智者必怀仁。”
命好，眼光好，位极人臣，说的就是萧瑀了。要是放在小说里，这就是妥妥的主角模板。但也不知是命太好了，还是觉得自己资历太深有恃无恐了，已经到了李世民当皇帝的时候，萧瑀作死的毛病还是没改了。
李世民刚封他为尚书左仆射不久，一次朝议，萧瑀与一位大臣吵了起来，李世民都喝止不住。气得李世民当场罢了俩人的官职爵位，让俩人闭门思过。
另一个官员倒是老实思过了，但萧瑀觉得憋屈竟然一病不起，李世民无奈，只好派人去安慰，勉励，不久又起用了他，这事才算解决。
现在变成御史大夫，是因为他被人给告了。萧瑀跟唐俭的关系好，得知唐俭要出使突厥的时候，写了一封家书，想让唐俭交给萧皇后。姐弟二人从小相依为命，感情多深自不必说，写一封信按道理来说没什么问题。但坏就坏在，唐俭路过李靖大营的时候，曾逗留过一天，李靖设宴款待唐俭，席间唐俭说了此事，也不知怎么就传到了长安某位御史的耳朵里。御史都是没事找事的人，听闻此事，匿名写了一封奏折，告萧瑀私通亡隋皇后，有通敌造反之嫌。
这件事证据确凿，李世民只好罢了他的宰相。但李世民怎么可能相信这种鬼话，他也知道这位御史的动机，随后就让萧瑀做了御史大夫，是为了震慑，还是为了给萧瑀出气就不可知了。
萧瑀当了御史大夫，却没有公报私仇。因为他把这仇记在了李靖身上，觉得是李靖泄了密。赶在李靖大军还朝，最风光的时候，他上奏本告李靖治军不严，纯粹是为了给李靖添堵，让他难受。
正巧李世民不知如何封赏李靖，担忧他功高盖主，时机刚刚好。李世民借此机会训斥了李靖，又免去了封赏的难题。李靖心知肚明，故此才一言未发，回家就闭门谢客了。
长安城中对此议论纷纷，支持哪一方的都有，只不过都不敢拿在明面上说罢了。至于程咬金、李绩、房玄龄、长孙无忌这个级别的人物，更是一个表态的都没有。帝王心思，谁敢乱猜啊，现在表态了，明天李世民又嘉奖李靖了，岂不是两面不讨好么？