之后应仁之乱爆发，足利幕府自顾不暇，堀越公方只能继续不尴不尬地留于堀越城中，再无缘镰仓公方之位。
后来幕府与古河公方达成停战协议（史称“都鄙合体“），承认了古河公方对关东公方继任的正统性，堀越公方就失去了名义上的合法性，更不容于关东之内，直至被今川家客将伊势盛时（北条早云）攻灭。
而古河公方的下场也甚为凄惨，在第四代公方足利晴氏与河越夜战中被北条氏所败后，就成为了北条家的傀儡，五代公方足利义氏死后，古河公方被废除。
至于小弓公方，则是第三代古河公方足利高基（足利高氏）的弟弟足利义明被上总武田氏所拥立，于下总国的小弓城（今千叶县千叶市）建立的，宣称自己才是第二代古河公方足利政氏的合法继承者，一直与足利高基对抗。
不过小弓公方存在的时间也并不长，足利义明在自立为公方后不久，就在与北条家的“第一次国府台合战”中战死了，小弓公方就此灭绝，其领地和遗臣尽被里见家所得。
从这些历史就可以得知，足利家在取得天下大权之后，其实是仿效华夏周朝的做法，将自己的亲族分封到日本各地的，其中陆奥地区就有筱川公方、稻村公方。
可惜这些公方都没怎么起到巩固幕府统治的作用，故此幕府后来也不再分封公方了，不过正常分封的公方没有，但是由于战乱和争斗等原因，足利家的公方还出过不少，其中有越前的鞍谷公方，畿内的堺公方，阿波国平岛的平岛公方（堺公方流亡到阿波国后改称），越中国的越中公方。
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