但乔丹当时还没想过要和朱妮塔结婚，虽然他们已相识四年，并且曾两次谈到过结婚。乔丹还是有些犹豫，这个时候的他对未知的新生活有些却步。认识乔丹的人都说他确实是想结婚的他已经找到自己生命的伴侣，只不过他还需要去发现这点，但是请相信，那会很快的。
乔丹自己也对朋友谈到，他感到他与朱妮塔关系已发生变化，具体说就是从亲密发展到了相互的承诺。89年一次采访中，乔丹再次表示要接受与朱妮塔的婚姻关系，但婚礼一直等到这个赛季结束之后才举行。
89年9月2日，乔丹和朱妮塔在拉斯维加斯的一座教堂中举行了姗姗来迟的婚礼，此时，他们的儿子迈克已经10个月了。新郎和新娘皆穿蓝色牛仔裤，两人的几个朋友出席了仪式。乔丹给他的新娘戴上了一颗5克拉、价值约25000美元的钻戒，朱妮塔也把一颗重3克拉，价值约15000美元的钻戒套在他的手指上。
这对新婚夫妇并没有去度蜜月，他们婚后马上飞到了圣地亚哥，乔丹要在那里为“统一黑人大学基金会”举办高尔夫球义赛。不久，他们的第二个孩子詹姆斯和小女儿朱妮塔也相继来到了人间。妻子朱妮塔赞扬乔丹，说他很懂情理，是个称职的丈夫，是孩子们尊敬的父亲。
她说：“我嫁给乔丹，不是为了钱，也不是为了他的名望。作为一个女人，到了出嫁的年龄，当然要选择一个好人作丈夫，而乔丹就是这样的好人。”乔丹也认为这很完美年龄不是一堵墙，我们很般配。她温柔体贴、善解人意，和她在一起，仿佛忧虑从来不曾降临。
随后，一个新的赛季就要展开了，而这时另一个乔丹生命中至关重要的角色登场了。公牛在赛季前宣布助理教练杰克逊接替科林斯成为芝加哥公牛队的教练。杰克逊的到来是公牛队的一个转折点，也是乔丹王朝殿堂最重要的一根巨柱的撑立。这么说毫不为过，在篮球圈子里，乔丹真正的朋友不多，巴克利可以跟他无话不谈，但若问乔丹最钦佩的人，毫无疑问只有杰克逊。
杰克逊87年踏进芝加哥，协助科林斯，科林斯辞职后，杰克逊顺理成章接过帅印。杰克逊对中国道教和佛教颇有研究，并将其心得用之训练和管理球队上面。他与球员之间相处的方式也与众不同。善于把握每个球员不同的心理和个性，因势利导，使球队十几个人很快就融为一体。他也凭此赢得禅宗大师的美名，并博得了乔丹的由衷信任。
杰克逊是个了不起的家伙，这一点现在我们都应该知道了，但是当时并没有太多人认识到，可是乔丹很尊敬他，并且尝试接近他、了解他，因为他发现这个高深莫测的大胡子非常了解自己，正像杰克逊说的那样：“多数人认为乔丹是一位非常优秀的运动员。他跑得很快，跳得很高，可以例行公事地投进压哨球。对他们来说，乔丹只是一个在身体条件上优于他同时代的人。这些都是真的。但我认为他们还漏了一些就是乔丹对于集体概念的理解他竞争的源动力以及他的同情心一正是这些背后的东西使得我与迈克尔紧紧连在了一起。我必须承认对他的领导能力以及抓住机遇的机会很嫉妒。他可以很轻松地平均每场得30分，但是他同样对全队得分起到了作用，并使得他的同伴们很兴奋。”乔丹听过这些话后对杰克逊无比赞同，从此衷心听取教导，直接导致呈现辉煌