在旗木真嗣与宇智波止水将从雾隐那里夺来的加密卷轴送回木叶后，便被封印班破解出来了。
原来是一个战略卷轴，一个是部分的秘密据点，在波风水门的带领下，轻易便摧毁了雾隐的据点和计划，导致本就向木叶方向倾斜的胜利天平一下子彻底倒向木叶了。
宇智波止水凭借自己精湛的幻术和高超的瞬身术成功在此次战争中打出了“瞬身止水”的名号，宇智波一族的天才再次传遍忍界。
虽然在得知宇智波带土失踪后的宇智波富岳也有些惆怅，他本来对宇智波带土这个大器晚成的孩子抱有很大期待的，但是事已至此，他只能将其归为天命了。
好在族里的宇智波止水和自己年幼的长子十分有天赋，这让宇智波富岳多少心里有些安慰。
宇智波止水虽然开启了万花筒写轮眼，但他将这个秘密隐藏在了心里，他能够感觉到自己的崛起已经让木叶高层有些难受，宇智波一族和村子的关系一直都很微妙，为了不产生没有必要的摩擦，自己觉醒了传说中的万花筒写轮眼的事情还是暂时藏在心里比较好。
此时的宇智波止水就已经敏锐的觉察出了村子和家族之中存在的矛盾，他想找方法解决这个问题，但是始终没有找到答案。
在这个战争中除了宇智波止水出名外，还有旗木卡卡西凭借着精湛的忍刀术博出了“木叶小白牙”的名号。尤其是在当下这个时间段，旗木卡卡西身为火影系的天才跟宇智波一族年龄相近的宇智波止水不相上下，这让木叶高层多少心里得到了点安慰。
旗木真嗣虽然不逊色于宇智波止水和旗木卡卡西，但是他还是觉得自己实力不到达影级的时候还是稳一点比较好。
其实如今有了万花筒写轮眼的宇智波止水已经踏入了影级，使用万花筒写轮眼的宇智波止水，就连现在的旗木真嗣也没有把握将其战胜，别说他还有别天神那样逆天的Bug瞳术了。
这其实也怪不得木叶高层们在得知宇智波止水的瞳术之后会惊慌，更别说如同团藏这样有野心的人会夺取宇智波止水的眼睛，毕竟能够悄无声息的改变一个人的意志，这种瞳术换谁谁不害怕。
但是很可惜的是，宇智波止水过于天真，就连匹夫无罪，怀璧其罪这样的简单道理他也不懂，这是对于三代目火影的过分信任吧。
就当着团藏和三代目火影一众木叶高层面前直言自己的瞳术能力，宇智波止水呀，宇智波止水，你就算要说，能不能只跟三代目火影说呢。
在团藏这个阴谋家面前，竟然还敢说出自己的别天神，不得不说宇智波止水的天真和愚蠢。
言归正传，在波风水门深思熟虑后，波风水门有把握今天便是木叶和雾隐的最终一战，只要此战胜利之后，雾隐便再没有余力跟木叶作战了。
很快这场战斗便打响了，不出预料，波风水门带领木叶的部队将雾隐忍者打得节节败退，雾隐方面只得向木叶投降，签订条约。
目前为止，木叶与雾隐和岩忍已经成功签订和平互不侵犯条约了，而与此同时，大蛇丸亲自带队突袭桔梗山也顺利将砂隐忍者重创，砂隐如今已经没有一战之力了，就等着砂隐方面的投降。
可以说，第三次忍界大战即将落下帷幕！
此时的木叶军营中，所有的木叶忍者都在欢庆终于结束的战争，只有一个人躲在角落中沉默不语。