为了在这次历史性的碰撞中取得胜利，同时也是为了完成对西方世界的彻底消化，占领教廷以后，科学教又花费了整整十年的时间来进行各种准备工作，尽管如此，面对那个近千年来始终代表着地球世界最高魔法成就的国度，魔法师们依然缺乏自信，据说，计划启动的时候，联席会议军事委员会的主席都已经在自己的抽屉里准备好了辞职报告。
事实证明，依靠内外丹理论武装起来的东方魔法师们果然是强大的，尤其是那些在各自的洞天福地里已经宅了几十乃至上百年的，号称仙人的老家伙们，其个体爆发力甚至连科学教当时的七大科学巫妖都不敢当其锋芒。可尽管如此，东方世界最后还是扑了……
东方魔法师们实在是宅得太久了，已经和世界的发展趋势脱节了，他们以为，在东方世界，枯魔的状况依旧，西方那些跨海而来的魔法师们，即便在本土上再强大，在这个魔法网络依旧混沌不明的地方，却只能任人宰割，在他们看来，枯魔期的现实，本就是保护东方世界安定的一道最坚固的屏障。
应该说，他们这个看法并没有太大的错误。实际上，如果这场战争早个三五十年爆发，那么挨打的肯定就变成了科学教的一方，可就在不久之前，英格兰的联席会议总部已经充分肯定了吸血鬼血液的妙用，并且将这一划时代的成就充分普及到自家成员的手上，这一英明的决策，为最终的胜利奠定了基础。
本来，东方魔法师们最引以为傲的，就是自家的个体战斗水平。尽管，无论在人数，还是总体的理论成就方面，东方世界未必能够高于西方的同行，然而要说在短时间内所能够释放的魔法数量上，七八个西方魔法师加在一起都比不过一个东方的仙人，这一点，在之前的几百年里早已得到了证明，然而这一次，局面却变了。
当随便一个西方阵营里的学徒都能面不改色连甩百八十颗火球的时候，当解离术这样的高等魔法被人当成不要钱的茶水随处泼洒的时候，东方的魔法师们唯一能做的就只有黯然接受失败的苦果，同时，也宣告了枯魔期尾声的到来。
面对潮水一般汹涌而来的新时代，大陆上的东方魔法师们陷入了漫长的痛楚之中，一方面，在理智上，他们清楚地认识到，唯有变革才能带来新生，然而另一方面，他们却始终不舍得这千年以来心血凝结的研究成果，以及伴随这份成果的巨大荣耀。相比之下，那些很久以前就移民到东瀛列岛的魔法师后裔们却没有这方面的问题，几乎十分自然的就接受了科学教这一崭新的事物，以及伴随而来的革新运动。
摆在岛国魔法师们面前的现实是，科学教花费了足足八百年才最终在西方世界站稳脚跟，虽然，这其中很大程度上有教廷等各方势力干扰的原因，但无论如何，东瀛的魔法师们可没有耐心等八百年，实际上，他们连一百年都等不下去，于是，一个非常冒险然而却切实有效的计划，在一群志士的手中诞生了。
首先，志士们发动了一场大规模的革命，给出的理由是需要让自身占据高位从而方便普及科学教义，这一步，由于科学教的先进地位已经得到所有魔法师的公认，所以进行得非常顺利，统治东瀛两百年的幕府将军只能乖乖的为新的统治者们让位。于是紧接着，以迅雷不及掩耳之势，一场让民间魔法师们始料不及的革新开始了。
在东瀛民间已经传播几千年的民间神社和魔法师组织全部被取缔，所有的施法者只有两个选择，要么归入倒志士们所主导的国家神道中去，要么就只能在监狱里过一辈子，依靠着这样简单、粗暴但是有效的手段，东瀛的全部魔法力量被集中在志士们手中，之后，一个有十二个节点构成，覆盖到全岛的洗脑法阵发动起来，一夜之间，在所有东瀛老百姓的脑子里埋下了关于科学的坚定信仰，一步登天，实现了伟大的百年跨越。
这场变革，在正统历史上被以统治者的年号进行命名，然而在魔法师之间却有一个通俗的名字更加深入人心：洗脑维新。
这场华丽丽的洗脑魔法固然为东瀛魔法界的兴起提供了基础，可说到底这种伟大跨越的方式，实在是有点匪夷所思，因而，这些国家神道的志士们在很长一段时间里，始终被科学教的各大派系排斥在外。于是，志士们迫切的需要一个机会，来证明自己，已经完全的进入了科学的世界，游目四顾，他们发现，大陆上那群现在还犹豫着要不要向科学教靠拢的家伙，实在是不错的靶子……
此时的东方大陆上，刚刚结束了一场大规模的战乱。战乱本是由从西方逃亡过来的基督教残余势力所引发的，虽说这些残余势力的力量算不上强大，但是对于刚刚遭受了重创的东方魔法师们来说却无疑是雪上加霜，不过好在，当依靠科学教的帮忙扑灭了这些宗教残余势力以后，也终于让残余的东方法师们下定了变革的决心，只不过，决心是下了，可到底要怎变，是急变还是缓变，以及是否要抛弃旧日的荣誉，这无数的念头依然困扰着东方魔法师们，其结果就是，进两步，退一步，事倍功半。
本来，东瀛的魔法师实力，和大陆上的同行们有着巨大的差距，然而当看到，仙人们在接连的两场浩劫却彻底伤到了元气以后，磨刀霍霍的国家神道志士们毫不犹豫的投下了赌注，于是，一场震惊世界的大海战登上历史的舞台。
这场海战，似乎在开始以前就注定了是一场悲剧，遭受浩劫的仙人们对于是否应对以及如何应对来自海上的挑战始终争论不休，其结果就是，英勇的水师战士不得不孤身面对倾国来攻的海上巨寇……
战斗的结果，东方的水师虽然全军覆没，然而说到东瀛方面，却也未必获得了胜利。由于战士们的英勇奋战，国家神道一位强大的施法者，洗脑法阵的十二节点之一，永远的葬身海底。失去了完整的洗脑法阵，虽然并没有动摇到民众对科学的信仰，但是对国民的理性思维造成了巨大的伤害，这种伤害，短时间虽然看不到效果，却最终导致了国家神道的毁灭。
海战的重大失利终于导致变革成为东方世界由上到下的共识，不满于老一辈犹豫反复、徘徊不前的作风，青年一代的东方魔法师们不惜以暴力手段争夺变革的主导权。然而，当他们真正做到高位时，却又同样陷入了如同老一辈一样的疑惑。
是像东瀛那样，走一条异想天开的捷径，还是如同欧洲那样循序渐进的发展，不同的道路之间应该如何选择的问题，困扰了连续几代人，更糟糕的是，不使用暴力的默契已经被打破了，同样打着复兴的旗号，面对那些与自己不同意见的人，当说服不再有效——有的时候连说服都懒得去说，便毫不犹豫的打算从肉体上消灭之。由此，一个混乱、血腥而又灰暗的杀戮时代拉开的序幕。
与之相对应的，是失去了理智束缚的东瀛社会上，什么共产主义、幻灭美学、下克上等等，邪恶、丑陋而又莫名其妙的种种思想就好像韭菜一样纷纷冒出并且一一流行开来，整个国家由上到下陷入了彻底的癫狂，到处都是一片热血沸腾场面，不过，正如每个医生都了解的道理，血太热了，早晚烧坏脑子。
而此时的欧洲，却也同样不太平。人类至上、无政府主义、环境保护……因社会进步所引起的思想大爆发浪潮席卷整个西方世界，并且，已经有一些思想冒出了可能威胁到科学教信念体系的苗头，这一切都让联席会议难以容忍，毕竟，化石事件（详见科学教大事记）已经给大家找了太多麻烦，魔法师们实在不想再次出现意外。