在十二金仙全力冲杀之下，九幽大阵渐渐失去威力，显出本来面貌，这时东南西北四路大军，加上轩辕共五路大军将蚩尤团团围住，蚩尤的八十一位兄弟也大都死在十二金仙手中，仅剩蚩尤一人，轩辕走下战车对蚩尤喝道：“蚩尤，你残暴不忍，带领族人挑起战争，使得生灵涂炭，如今你已是穷途末路，还不快快束手就擒。”蚩尤看着八十一位兄弟个个惨死，蚩尤双眼寒光直射，带着无尽的怨恨环视一周，仰天怒吼道：“天道不公，觉我巫族，我永不甘心！永不甘心！”十二金仙几人被看蚩尤扫过一眼，直觉浑身一阵寒意上升，再听蚩尤怒吼，惧留孙却是看不下去，挥手放出捆仙绳将蚩尤困住，道：“你等巫族逆天行事，天道不容，且容你在那乱吼。”
擒下蚩尤之后，孔宣同十二金仙向轩辕告辞，轩辕带领大军压着蚩尤凯旋而归，待回到都城之后，轩辕下令将蚩尤斩首示众，不料蚩尤大巫之身寻常兵器却是伤不得蚩尤分毫，蚩尤站在那里哈哈大笑，嘲笑轩辕无能，轩辕见此，提起轩辕剑，向着蚩尤颈部一剑划过，蚩尤头颅被看落在地，轩辕又是四剑，将蚩尤四肢也斩了下来，下令将蚩尤肢体分别封印在天地五方，使之不得完尸。
至此逐鹿之战之后，天下始归一统。于是轩辕制礼兴乐，教化百姓。同时还发明各种器具用物，方便日用。其中伯余造了下衣，於则做了鞋子。百姓们从此不再穿兽皮树皮。黄帝还依浮叶飘于水上的道理作了舟船，共鼓又配上舟揖行于水上。又根据转蓬的道理发明了车辅，便利了交通。黄雍父发明了春，黄帝接着又令人制作了釜甑，使得百姓可以蒸饭烹粥。他还确定了天下万物的名称，划分星度为28宿。以甲乙十天干纪日，以子丑十二辰来纪月，而六旬为一甲子。如此又有时空观念。史称当时的百姓"甘其食，美其服，乐其俗，安其居。"一派太平景象。
而在轩辕斩杀蚩尤之后，洪荒大地巫族全灭，六道轮回中后土也是双眼泪如雨下，却是天道限制，不能出手相救，只好眼睁睁看着最后的巫族被天道借得轩辕之手灭去。
谁说圣人无情，却是未到至情时，君不见元始天尊为的弟子，大破九曲黄河阵，击杀三霄。据不见通天教主一怒之下大摆诛仙剑阵。圣人虽然元神寄托虚空融入天道，却并不是天道，每个圣人都有心中的执念所在。
正当后土为巫族灭绝，自己束手无策，伤心自悔之际，突然间整个六道轮回一阵巨震，接着射出光柱直插云霄。一阵浩大诡异的威压瞬间扩散至整个洪荒，后土被这剧烈的变化惊醒，这六道轮回可是她一身所化，后土自是紧张，也顾不得伤心急忙赶往光柱之处查看。
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